医学·药学
王刚刚, 刘琳, 尤伟艳, 梁伟华, 蒋金芳, 李洪安, 胡建明, 常彬, 赵瑾, 李锋
石河子大学学报(自然科学版).
2011, 29(4):
465-470.
为检测新疆维吾尔族宫颈癌中HPV16变异情况,并建立HPV16系统生成树。选用HPV16感染的维吾尔族宫颈癌40例,德国HPV16标准株做阳性对照,PCR扩增HPV16E6后纯化并双向测序;应用Lasergene、DNAstar、clustal 1.83、Mega 4.1软件对HPV16E6序列进行比对分析,并最终生成系统生成树。结果显示:在40例维吾尔族宫颈癌中发现HPV16变异位点4个:350nt(T→G),310nt(T→G),295nt(T→G),135nt(A→C);变异率最高位点为350nt(71%,20/28);相应氨基酸变化为L→V,F→L,D→E,K→T。通过系统生成树发现,本组样本全为欧洲变异体;HPV16E6 350位点变异与分化程度及年龄分组分别作比较(P>0.05),两者之间无统计学差异。由此可知,从系统生成树角度分析,维吾尔族宫颈癌中HPV16变异体为欧洲变异体;突变率最高位点为高危的350位点,其次为310、295、135位点,这些变异位点与维吾尔族宫颈癌的相关性有待进一步研究。